單細(xì)胞揭示地錢(qián)發(fā)育
時(shí)間:2023-06-23 20:15:19
苔蘚植物是植物界最原始的類(lèi)群之一,它們生長(zhǎng)在濕潤(rùn)和陰暗的環(huán)境中,沒(méi)有根、莖和葉等器官,也不能通過(guò)維管束進(jìn)行水分和養(yǎng)分的輸送。盡管苔蘚植物在進(jìn)化上具有重要性,并且擁有相對(duì)簡(jiǎn)單的植株構(gòu)造,但是人們對(duì)于其細(xì)胞類(lèi)型組成以及成熟和衰老的軌跡還知之甚少。近十年來(lái),單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展為人們回答這些問(wèn)題帶來(lái)了契機(jī)。
(資料圖片僅供參考)
6月14日,《發(fā)育細(xì)胞》( Developmental Cell )在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心研究員王佳偉團(tuán)隊(duì)題為 The maturation and aging trajectory of Marchantia polymorpha at single-cell resolution 的研究論文。該研究以苔類(lèi)植物地錢(qián)( Marchantia polymorpha )為模式,利用時(shí)間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(time-resolved scRNA-seq)描繪了全球首張?zhí)μ\類(lèi)植物的細(xì)胞圖譜。該圖譜揭示了地錢(qián)由休眠孢芽(dormant gemma)發(fā)育成為成熟葉狀體(mature thallus)的細(xì)胞類(lèi)型動(dòng)態(tài)變化軌跡,并在單細(xì)胞分辨率下確定了葉狀體的兩個(gè)成熟和衰老軌跡:即組織和器官沿中脈頂端(tip)至基部(base)逐漸成熟衰老的空間衰老軸(spatial axis)以及頂端分生組織活性隨時(shí)間逐漸下降的時(shí)間衰老軸(temporal axis)。
以地錢(qián)特有的油細(xì)胞(oil body cell)為例,靠近中脈頂端分生組織區(qū)域的幼年期油細(xì)胞主要進(jìn)行次生代謝化合物的合成工作,這些有毒代謝物的積累是地錢(qián)抵御昆蟲(chóng)取食的主要方式。隨著時(shí)間的推移,葉狀體基部的成年期油細(xì)胞則逐漸轉(zhuǎn)向進(jìn)行光合作用,提供葉狀體發(fā)育所需的能量。
此外,研究還觀察到分生組織活性的下降與地錢(qián)營(yíng)養(yǎng)繁殖器官孢芽杯(gemma cup)的形成密切相關(guān),提示“優(yōu)先把能量分配給繁殖以保證產(chǎn)生后代”這一策略在地錢(qián)中同樣存在,是一個(gè)古老且進(jìn)化上保守的發(fā)育機(jī)制。
該研究不僅為其他苔蘚植物單細(xì)胞圖譜的繪制提供了有益參考,而且還為陸地植物細(xì)胞類(lèi)型演化規(guī)律的研究奠定了良好基礎(chǔ)。此外,研究人員在地錢(qián)單細(xì)胞圖譜中發(fā)現(xiàn)了一些細(xì)胞類(lèi)群特異性基因,這將為人們進(jìn)一步闡明地錢(qián)年齡進(jìn)程的調(diào)控機(jī)理提供寶貴的基因資源。
相關(guān)研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金委基礎(chǔ)科學(xué)中心項(xiàng)目、中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)等的支持。
(A) UMAP展示地錢(qián)休眠孢芽(第0天)到成熟葉狀體(第31天)的單細(xì)胞圖譜。圖中每個(gè)點(diǎn)代表一個(gè)細(xì)胞,同一顏色代表同一細(xì)胞類(lèi)群。圖譜總計(jì)46136個(gè)細(xì)胞,共21個(gè)細(xì)胞類(lèi)群。(B) UMAP展示孢芽和葉狀體細(xì)胞類(lèi)群的時(shí)間變化軌跡。6種顏色標(biāo)識(shí)6個(gè)取樣時(shí)間點(diǎn)。圖中可以看到,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組存在巨變(孢芽萌發(fā))和漸變(葉狀體發(fā)育過(guò)程)的兩種情形。(C) 地錢(qián)葉狀體頂端和基部油細(xì)胞沿中脈成熟和衰老示意圖。頂端幼年期油細(xì)胞產(chǎn)生大量有毒次生代謝產(chǎn)物,而基部成年期油細(xì)胞則轉(zhuǎn)向進(jìn)行光合作用。(D) 地錢(qián)葉狀體的兩條成熟和衰老軌跡。圖片上部示意圖展示了地錢(qián)從休眠孢芽(第0天)到成熟葉狀體(第31天)的發(fā)育過(guò)程(注:葉狀體形狀與大小隨發(fā)育進(jìn)程而逐漸改變)。底部堆疊示意圖展示了葉狀體的兩條成熟和衰老軌跡,即沿著中脈逐漸成熟衰老的空間衰老軸以及位于頂端分生組織的時(shí)間衰老軸。孢芽杯的形成可以導(dǎo)致葉狀體頂端分生組織活性的下降。
來(lái)源: 中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心
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